При загрузке входных изображений, имеющих одинаковое название, из источника типа Папка на FTP-сервере в выходной папке появляются изображения, которые были обработаны ранее и не появляются те, которые должны были быть обработаны.
Пример: в папку на FTP-сервере загрузили  файл Test.tiff (отсканированная копия счет-фактуры). Данное изображение было успешно обработано FineReader Server 14. Затем пользователь в ту же папку на FTP-сервере загружает еще один файл с именем Test.tiff (отсканированная копия договора). После обработки в выходной папке находятся два файла распознанной копии счет-фактуры. 

Причиной такого поведения комплекса может служить включенное кэширование FTP-сервера. Кэширование не позволяет перезаписать уже имеющиеся/ранее хранившиеся файлы на ftp-сервере при совпадении имен. 

В данной ситуации мы можем предложить следующие решения:

1. Настроить кэширование FTP-сервера;
2. Использовать уникальные имена файлов при загрузке на FTP-сервер.