Для работы в ABBYY FineReader PDF 15 в PDF редакторе с SharePoint-файлами можно порекомендовать такие варианты:
1. Использовать OneDrive Client для SharePoint, который будет подгружать PDF файл локально и после его редактирования и сохранения синхронизировать с SharePoint-файлом. Для этого достаточно установить FineReader PDF 15 приложением для просмотра PDF файлов по умолчанию и открывать нужный PDF файл из локальной папки OneDrive, синхронизируемой с SharePoint. 
Детальнее о работе с облачными хранилищами описано в статье справки.

2. Работать с SharePoint-файлами можно в ситуации, когда папки SharePoint открыты через Explorer (Проводник): описание есть здесь. 
Такая возможность есть только в Internet Explorer 11, для других браузеров OpenWithExplorer не поддержан.
Для папки SharePoint нужно выбрать View in File Explorer:
​

Предоставьте разрешение:
​

После этого папка SharePoint откроется в Проводнике:  
​

По двойному щелчку мыши на PDF файле он откроется в PDF редакторе FineReader PDF 15.
Далее можно следовать описанию из раздела справки - начиная с пункта 2 "Заблокируйте документ на сервере,..".